原作的世界观设定（必看）
本作可能会用到，或者修改的。
首先按照GX里说的，现在整个是分为12个次元，以12个不同的宇宙存在，对应着12个星。然而6Ds中又出现了负等级只是正常次元中的负面世界，就像镜子一样（大概）。现在又出现了zexal中的阶级，由于还没有具体说明，所以不好推断。再加上蟹爷说同调是人类进化的象征（这并不假），而Z里面没有同调，但是科技却比6Ds要先进。所以推测，要么是平行空间（难道超出了12次元！！），要么恭喜Z－ONE爷爷！你的目的达到了！！
咳咳！重回话题。人类所居住的只是12次元中其中的一个次元，其他的次元就不用多说了吧，就是决斗精灵的世界。这从GX中，十代他们不停地穿越不同次元寻找约翰可以看出，虽然都有决斗怪兽的存在，但是所在的次元不同。每一个次元都有通向下一层或者上一层的门（就是暗约翰和凯撒决斗时身后的那个门），这也可以进一步说明12次元的等级之分是存在的。
然后再回到10000年之前，也就是亚特兰提斯文明还存在的时候。那个时候按照达姿所说，人类与决斗的精灵是共存的，那我们也就有理由相信当时并没有分成12个次元，而是一个整体。至于之后发生了什么事情导致分裂出12个次元，以至于这个宇宙中没有精灵，那就不知道了。但是可以肯定的是这个次元是主要的。（难道是被吉尔伽美什的Ea劈了？？）
大体的世界观就到这里。
决斗怪兽，最古老的游戏，古埃及在3000年前将决斗怪兽视为决定命运的仪式。任何人都可以召唤决斗怪兽，而从埃及记忆篇中我们可以知道，决斗怪兽反映的是人类的心灵。但是有魔物也有精灵。从这一点可以看出，亚特兰蒂斯事件之后，虽然精灵们离开了，但是依旧与这个次元有着微妙的联系。人心的善恶，反映出召唤出的是魔物还是精灵。
在古埃及王朝衰败后，就埋藏于地下。直到佩格萨斯将它们挖掘出来制成游戏卡片。从此，异世界的精灵们有了与这个世界真正的连接方法。而且，人类更加可以创造出新的决斗精灵，新生侠就是很好的例子。
再说说光与暗的问题。个人认为按照游戏王的世界观来说，宇宙中应该分4种势力。1.正义的黑暗。代表人物：游戏，十代。。代表人物：黑暗大邪神，DARKNESS。3.守护之光。代表人物：光之创造神。4.毁灭之光。代表人物：斋王琢磨（毁灭之光），光之金字塔。
最后来说最难说的历史问题。
跳过DM，GX的正常走向不提，6Ds完全与前面衔接不上。起先我以为是平行空间，但是从剧场版来看，游戏的DM十代还是存在的。又从Z－ONE的回忆中可以看出，他所查阅的游星的资料直到暗印者为止就没有了。随即与同学讨论得知，之后的一切都是Z－ONE弄出来的。
正常的历史，零点反转依旧发生，而游星在没有红龙的帮助下打败了4位觉醒的暗印者（米丝蒂，鲁道加，鬼柳，迪马克），之后依然组成了5Ds队，并自行领悟了加速同调和三角加速同调，只不过历史记载的三角加速同调的怪兽是宇宙耀变龙（コズミック?ブレイザ??ドラゴン）。
然后到了未来，人心被**所支配，同调被引向了错误的方向，导致MOMENT制造机皇帝灭世。在Z－ONE地努力无果下，最后世界只剩下了4个人类Z－ONE，阿波利亚，帕拉多克斯，安提诺米。他们4基友（误），研究着如何改变世界，最后的结果是需要回到过去。但是此时的他们都已经是花甲的老人，除了Z－ONE以外的其他人都死去了，于是Z－ONE制作了他们的复制人，并将它们送到了过去。
这里不得不提的是，以上并没有出现红龙。因为当时红龙.根本不存在。
当世界毁灭时，镜头中出现的那轮类似夕阳一样的球体，成红色状。在红龙的力量的相互撞击下（杰克第一次对战游星，星尘对真红）时，海马公司的MOMENT曾经发生过能量超标的现象。因此，可以将红龙与MOMENT联系起来。而且最后的红球可能就是MOMENT的意识终端。
MOMENT可以读懂人心，因此可以推断出MOMENT读出了最后那4人的叹息，以无上的神力……开玩笑的！将红龙送回了过去。
然而回到过去的途中出现了差错，红龙一部分力量在回到了10000年前（可能是在亚特兰蒂斯文明消失以后的事件段），被地缚神同化成红莲恶魔（也就是羽蛇神库库尔坎的样子），结果被杰克的前世（姑且这么认为）用燃烧之魂封印（比普通地缚神的封印NB多了）。
按照《Steins；Gate》的观点，就是世界分支成了β世界线。与原α世界线的走向不同。
然后过了5000年，除了红莲恶魔以外的地缚神破除封印，红龙率领着手下们再次封印了它们。战斗中的古代妖精龙受伤封印，生命洪流龙在5000年的时光中被遗忘。（PS：黑羽龙不是红龙的手下。）所以严格来说，是6龙印者，5条龙。（受不了K社的黑历史啊！！！！！！！！）
然后3000年前，星之民的信仰开始了。
与红球派出的红龙不同的是，Z－ONE让阿波利亚的分身们回到了正确的时间点，也就是零点反转的时间段，并暗中控制了一切。而之后就如同剧情一样，没有什么好讲的吧。
虽然是β世界线，但是Z－ONE与红龙改变历史的方向不一样。Z－ONE希望毁灭新?童实野市，红龙希望选出领导人，将世界引向正确的发展。
这也是之后为什么会发生弧形摇篮事件了。
个人认为，其实Z－ONE的心理也不想毁灭新?童实野市。不然他为什么派安提诺米下来帮助游星，还放下了流星龙石板。从Iliaster三皇帝的对话中可以看出，降下流星龙石板的，不是红球，而是Z－ONE。也许Z－ONE的潜意识里也希望正牌的游星来阻止自己吧。