1775年7月3日，雄姿英发的华盛顿把队伍集合起来，在距离指挥部约半英里的广场上走马上任，就任大陆军总司令官。在此之前，许多市民都赶到广场旁边的老榆树下来看热闹。

华盛顿在罗伯特·李将军的陪伴下开始检阅队伍，李将军看起来很像瑞典的查尔斯二世，粗犷、高贵。华盛顿十分相信自己的这位老战友，在宣布就职后他就带着这位老战友前去查看边防前线。

当时，驻扎在波士顿城里的英国队伍总司令官盖奇已无兵可调，城里的英国队伍已经所剩无几。大部队此时仍然被阻隔在波士顿城外的隘口。美队伍形成了一个半圆形的包围圈，从左边的冬山到右侧的杜切斯特隘口，全部都在美军队伍的牢牢控制之下。

华盛顿武装起来的民兵有1.4万人，这和过去估计的1.8万人有极大差距。由于战线拉得过长，严重损害了兵力的相互接应和补给。让他很头痛的是，美国队伍中的战士缺少组织纪律性。在视察过程中，华盛顿最满意的是哨卡。这些哨卡通过帕特南和亨利·托马斯将军的加固，暂时还比较坚固。

物资低劣并且缺少组织性、纪律性的杂牌军，牢牢围住一座城市这么长时间，让华盛顿十分感慨。通过了解，有9000名官兵来自于马萨诸塞州，其他5000人则来自其他各州，战士们各自都有自己的将领，将领都是被自行推选出来或是被任命的，他们分别驻扎在自己的营地里，将领们有的住在个人的帐篷里，有的则和战士住在一起。虽然条件很差，但战士们的情绪都很高涨，这是一种不屈的精神，华盛顿把这种精神叫作独立精神。

战争期间，康涅狄格州的总督乔纳森·杜姆布尔是华盛顿最好的合作者，此人不但接受过良好的教育，处理公共事务的经验也非常丰富。在美国独立战争期间，杜姆布尔堪称是一个灵魂人物，也是一位对民众幸福忠贞不二的殖民州总督。华盛顿刚上任，杜姆布尔就写信表示了支持，他还向华盛顿保证康涅狄格将是他最坚强有力的后盾，希望华盛顿能统一指挥队伍，为美洲人民争取和平和自由。

大陆会议在提拔将帅事情上有诸多不合理的地方，所以队伍里议论纷纷，华盛顿品格中的无私和公正派上了大用场，他负责平衡这些关系。斯宾塞将军因为帕特南职位的提拔非常不满，在没有见到华盛顿的情形下就离开了队伍。华盛顿来后做了大量的工作，他向将军介绍了帕特南无私纯洁的高尚品格和未来的战争，使斯宾塞将军又重新返回了军营。华盛顿虽然有很多朋友，社交面很广，但对自己要求严格，并没有沾染上吃喝玩乐的恶习。

由于总司令官地位的需要，马萨诸塞州大会责成大会委员会去为华盛顿寻找男女管家和和厨师，华盛顿的地位要求他的膳食结构应体现出热情好客的风格，管理厨房的人员为此颇费了一番脑筋。华盛顿每天都在对有关国家和军队的大事情进行思考，其他琐碎事务总是安排他的副官米夫林上校去做。约翰·杜姆布尔是康涅狄格总督之子，也是华盛顿的侍从官。此人颇得华盛顿的赏识，他也喜欢呆在华盛顿身边，非常崇拜华盛顿，但是他不久就和一位少将调换了工作，离开了华盛顿，原因是他不善于社交，恐怕胜任不了这项工作。

华盛顿将队伍分成三个部分，分别驻守三个地方。沃德少将作为右翼，驻扎洛克斯波利高地；罗伯特·李将军作为左翼，驻扎在前沿山和冬山一带；帕特南少将和海思准将防守中间部位，驻扎在剑桥。7月4日，由于华盛顿的推荐，总督之子约瑟夫·杜姆布尔于7月24日被任命为兵站总督，以前在康涅狄格的时候，他就担任过类似的职务。通过这样一番整顿，官兵的界限和职责被划分清楚了，军营里的秩序发生了可喜的变化，操练也逐渐变得正规起来。

李将军在改革军营事务中做了大量的工作。他总结了在欧洲战役中的经验，制定了一整套规章制度。但是他有些时候显得过于粗暴，在注重自己在军事上的权威。“上帝青睐最强的队伍”是他的座右铭。华盛顿和李将军不同，他喜欢以军令的方式执行决议，十分注重工作实效。

军营吸引着大家的目光，日常总会有许多人前来参观，莱福枪队让大家震惊。那些自地方队伍里选拔出来的精英，都长得非常强壮剽悍，许多人的身高都超过了6英尺，个个都是丛林战的高手。很像华盛顿早年接触过的一些人。丹尼尔·摩根上尉是土生土长的新泽西人，他负责指挥一只莱福枪队。他曾经在布雷多克军中服过役，并且担任过驾驶员，后来成为了一名将领。为了来到华盛顿身边效力，他和自己的队伍连续走了3个星期，行程超过600英里。

正当华盛顿紧锣密鼓调遣队伍准备攻打波士顿的时候，康涅狄格州总督和马萨诸塞州议会分别致信给他，请华盛顿派军队去沿海的几个地方进行保护。姆布尔在信里特别提到新伦敦地区的安全，令自己感到十分忧虑。华盛顿立刻与他的将帅们探讨了这一要求，从全局出发，华盛顿不失尊重地回绝了，并且给出了明确的答复。

华盛顿认为，把英国队伍从波士顿赶出来是当期主要的任务，虽然波士顿的英国队伍已经被围困了很长时间，却看不出有投降的意思。这是一场决定性的战役。华盛顿命令队伍把这个地区的牲畜赶离海岸，以切断敌人的补给线。在重重围困之下，英国队伍的食品和蔬菜几乎断绝，战士们已经没有了战斗意志，而这时的美国队伍则开始缩短包围圈。随着战士人数的增多，一个实际的事情摆在了华盛顿面前，那就是缺少弹药。通过多方努力，来自新泽西的弹药帮了华盛顿的大忙，一个难题解决了。

伴随着这场战争的进程，还有一件事情令人痛心：李将军在西班牙的时候，曾经是伯格因将军的部下，两人交情笃厚，经常有书信往来。原本同属于一支队伍，现在却为了各自的理想而战。当李将军听说伯格因来到前线时立即致信问候，不久，伯格因将军建议在双方都要承诺保证彼此安全的基础上，要和李将军会一面。马萨诸塞州地方会议对双方会面一事进行了探讨，决定批准这次会面。他们增派阿布里奇·杰里先生和李将军一同前去，目的是为了不引起大家的猜疑，并规定所有会面都要有杰里先生在场。李将军充分考虑了事情的后果，于是决定取消会面的计划。

华盛顿上任后把处理波士顿军营事务做为重点，同时，其他军营里的事务也义不容辞，这需要统筹兼顾。苏勒将军于7月份发来信件，华盛顿马上意识到了事情的危险性。这时候前方爱国志士正在前线浴血奋战，可是在内地的纽约西部和加拿大边境却相继发生了不少事情，约翰逊兄弟煽动了印第安人在纽约西部进行叛乱。还有，自从本尼迪克特和伊桑·爱伦占领香普兰湖和迪贡德拉以来，为了各自的利益，两个人都在明争暗斗，原因很多，主要是马萨诸塞州和康涅狄格州地方大会任命不合理，两人都有军事领导权和委任状，这让手下无所适从。虽然班尼迪克特·阿诺德自己也认为爱伦作为这个基地的指挥官比较合理，但既然议会已经给了他这项权力他当然不会主动放弃。对于如何解决这件事情，爱伦也有自己的看法。在写给阿巴尼委员会的信中，爱伦要求增加食物和兵力，帮助自己对这个地区进行控制。纽约州地方大会的看法是，倘若这样做了便是越权，所以把这个问题又交给了大陆会议。大陆会议在征求了康涅狄格州大会的意见后，又认为这件事情既然发生在纽约州境内，就应该由纽约州大会解决。